《应用生态学报》创刊于1990年，是由中国科学院主管，中国生态学学会和中国科学院沈阳应用生态研究所主办的综合性学术期刊，学报主要报道应用生态学领域的创新性科研成果与科研进展。

据2018年4月中国知网显示，《应用生态学报》总被下载3879263次、总被引325387次、（2017版）复合影响因子为3.267、（2017版）综合影响因子为2.166 。据2018年4月万方数据显示，《应用生态学报》2015年影响因子为2.11，载文量为8225，被引量为239761，下载量为248695。2015年影响因子排名为全部统计源期刊（6735种）第156名；生物科学（93种）第3名 。